所属类别：临时文章

文章作者：idleguy

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接了一个项目，要用到OpenPBS，完全没碰过的东西，上网找了找，好像资料也不多，没办法，自力更生-_-b...一点点学，一点点记，肯定还要写很多，最后再整理。转载（如果有的话）请保留当前完整。有指正或问题请idleguy@263.net,谢谢。OpenPBS & Interface Library--by 斜月 http://blog.csdn.net/idleguyOpenPBS安装1、 必须用root登录2、 创建安装路径，一般是：/usr/local/OpenPBS3、 cp OpenPBS安装包到安装路径并释放4、 进入释放的目录，例如：$>OpenPBS_2_3_16\5、 运行OpenPBS配置脚本：$>./configure Cprefix=/usr/local/OpenPBS./configure可以配置OpenPBS的环境，-prefix是一些安装目录的前缀，例如lib等，默认是/usr/local。可以./configure Chelp查看所有的参数。一般默认的就可以。6、 编译OpenPBS：在释放的目录下make.在make的过程中可能出现如下错误：make[4]: *** No rule to make target `', needed by `attr_atomic.o'. Stop.make[4]: Leaving directory `/g/pbs/OpenPBS_2_3_16/src/lib/Libattr'make[3]: *** [all] Error 2make[3]: Leaving directory `/g/pbs/OpenPBS_2_3_16/src/lib/Libattr'make[2]: *** [all] Error 2make[2]: Leaving directory `/g/pbs/OpenPBS_2_3_16/src/lib'make[1]: *** [all] Error 2make[1]: Leaving directory `/g/pbs/OpenPBS_2_3_16/src'make: *** [all] Error 2这需要一个补丁来解决,参见附录7、 安装OpenPBS：编译成功后，make install8、 创建节点(node)文件/usr/spool/PBS/server_priv/nodes文件内容是节点的机器名。例如node1node2……当然可以有更具体的设置. 包括机群系统中所有结点的描述，如主机名，属性和cpu的数目。结点文件的格式为：hostname [:ts] [property…] [np＝NUMBER] 。9、 建立MOM进程配置文件 在{PBS_HOME}/mom_priv目录下建立资源管理器守护进程的配置文件config。所谓{PBS_HOME}可以在安装的第一步./configure的时候指定，相关参数：--set-server-home={YOUR_PBS_HOME}，一般不用指定，用默认值就好了。默认值为/usr/spool/PBSconfig文件的内容通常包括： $logevent　0x1ff $clienthost server_host其中$logevent是为了设置记录作业执行事件日志的掩码，当其值设为0x1ff时，表示记录作业运行事件的所有日志信息；server_host是PBS服务器所在的主机名。OpenPBS启动1. 启动MOM进程$> /usr/local/OpenPBS/sbin/pbs_mom2. 启动OpenPBS服务器$>/usr/local/OpenPBS/sbin/pbs_server Ct create(第一次启动用户服务器时，需要“Ct create”选项，以后启动不需要)3. 启动调度器$>/usr/local/OpenPBS/sbin/pbs_sched(建议在$HOME/.bash_profile中加入OPENPBSDIR=/usr/local/OpenPBSPATH=$PATH:$OPENPBSDIR/bin: $OPENPBSDIR/sbinexport OPENPBSDIR PATH创建队列用qmgr创建队列，例如：#创建队列，并命名为normalqmgr -c "c q normal"#设定队列的类型为Executionqmgr -c "s q normal queue_type=Execution"#设定该队列中任务最大运行时间为24小时(CPU时间)qmgr -c "s q normal resources_max.cput=24:00:00"#设定该队列中任务最小运行时间为1秒(CPU时间)qmgr -c "s q normal resources_min.cput=1"#设定该队列中任务默认运行时间为12分钟(CPU时间)qmgr -c "s q normal resources_default.cput=12:00"#enable queueqmgr -c "s q normal enabled=true"#start queueqmgr -c "s q normal started=true"#将normal队列设定为默认队列qmgr -c "s s default_queue=normal"qmgr的参数中-c代表命令行，引号(“”)中的内容是要执行的命令。其中c是create, s是set, q是queue,所以，上述命令可以写作：qmgr Cc “set queue normal enabled=true”……提交任务可以用qsub,只有非root用户才可以提交任务。OpenPBS Interface Library OpenPBS Interface Library(IFL)是OpenPBS提供的一组函数，完成OpenPBS的任务。例如：pbs_connect,是连接服务器的函数。 编写程序调用这些函数需要以下两个头文件： #include #include和一个静态链接库：libpbs.a(可以在/usr/local/lib/中找到这个库)因为该库用C编写需要，如果用C++编写程序调用这些函数，则需要：extern “C”下面是一个示例程序(subjob.cc)，作用就是提交任务，如果成功返回该任务提交后在服务器上的任务标示，如果失败则返回错误代码：extern "C"//C 函数{#include#include}#includeint main(int argc,char** argv){ int Con=pbs_connect("server”); //连结服务器”server” printf("Con=%d\n",Con); char *Ret=pbs_submit(Con,0,argv[1],0,0);//提交任务 if (!Ret) {printf("ERR=%d\n",pbs_errno);//发生错误，打印错误代码 } else { printf("Ret=%s\n",Ret);//打印返回的任务标识 } delete Ret; return 1;}编译该程序：$>g++ -o subjob subjob.cc Clpbs附录安装OpenPBS过程中make出错如果遇到前文提到的错误，那么通过打补丁可以解决该问题。该补丁可以通过以下方法得到：1. 下载：http://www.webmo.net/support/patch/pbs.patch2. 将下面内容（=包括中的内容，不包含=）存入pbs.patch（当然，任意文件名）======================================================================--- /buildutils/makedepend-sh.000 Wed Nov 17 11:32:52 1999+++ /buildutils/makedepend-sh Thu Jul 10 13:35:43 2003@@ -574,6 +574,12 @@ test "$verbose" -lt 2 && errout='2> /dev/null' eval $CPP $arg_cc $d/$s $errout \+ sed \+ -e '1d' \+ -e '/^#.*/d' \+ -e '/^#.*/d' \+ -e '/^#.*/d' \+ -e '/^#.*/d' \ sed -n -e "s;^\# [0-9][0-9 ]*\"\(.*\)\";$f: \1;p" \ grep -v "$s\$" \ sed -e 's;\([^ :]*: [^ ]*\).*;\1;' \--- /src/lib/Liblog/pbs_log.c.000 Tue Dec 4 18:38:40 2001+++ /src/lib/Liblog/pbs_log.c Thu Jul 10 13:39:45 2003@@ -109,6 +109,7 @@/* Global Data */+#includeextern int errno;char log_buffer[LOG_BUF_SIZE];char log_directory[_POSIX_PATH_MAX/2];--- /src/server/svr_connect.c.000 Tue Dec 4 18:39:23 2001+++ /src/server/svr_connect.c Thu Jul 10 13:43:11 2003@@ -113,6 +113,7 @@struct connect_handle connection[PBS_NET_MAX_CONNECTIONS]; /* used by API */+#includeextern int errno;extern int pbs_errno;将该文件cp到OpenPBS安装包的释放目录，打补丁：$>patch -pl -b < pbs.patch然后就可以正常安装了使用IFL发生编译错误Q:提示找不到库libpbs.a。A:确定正确安装OpenPBS,lib搜索路径中包含libpbs.a.确定编译选项是-lpbsQ:提示找不到函数，例如undefined reference to `pbs_connect(char*)'A:在程序中这样包含头文件：extern "C"{#include #include }……Q:已经像上面那样包含头文件，仍然找不到函数，不过这次看起来有点不一样，例如： undefined reference to `pbs_connect'A:编译的时候，要将libpbs.a的引用放在源文件后面，例如：$>g++ -o subjob subjob.cc Clpbs关闭本页

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